Klinisk diagnosticeret med shigellose kan etableres kun i tilfælde af colitis variant af et typisk forløb af sygdommen. At afklare diagnosen ikke bekræftes laboratorie tilfælde rektoskopi, som i alle tilfælde af shigellose afslører et billede af colitis (bluetongue, hæmoragisk eroderende eller ulcerøs) fra den mucosale læsion af den distale colon, ofte sphincter.