De vigtigste manifestationer af mavesår er smerter og dyspeptiske syndromer (syndrom er et stabilt sæt af symptomer, der er karakteristiske for en given sygdom). Smerte er det mest typiske symptom på mavesår og sår på tolvfingertarmen. Det er nødvendigt at bestemme arten, hyppigheden, tidspunktet for forekomst og forsvinden af smerte samt dens sammenhæng med fødeindtag.