Hjernestammen er forlængelsen af rygmarven i rostral retning. Den betingede grænse mellem dem er det sted, hvor de første livmoderhalske rødder og pyramidernes krydsning afgår. Bagagerummet er opdelt i de bakre og midterste hjerner. Den første omfatter medulla oblongata, hjernebroen og cerebellum. Dens fortsættelse er den midterste hjerne, der består af firedobletter og cerebrale ben og grænser op mellemliggende hjerne (thalamus, hypothalamus, subthalamus).