Det forårsagende middel til krydsbåren viral encephalitis tilhører slægten Flaviviruses. Virionen har en sfærisk form, en diameter på 40-50 nm, indeholder RNA, reproducerer godt i mange vævskulturer. Af forsøgsdyr er hvide mus, hamstere, aber og bomuldsrotter mest modtagelige for viruset. Modtagelig for krydsbåren encefalitisvirus og mange husdyr.