HCV-genomet indeholder den positivt ladede enkeltstrenget RNA, som koder for 3 strukturelle (nucleocapsid kerneprotein og nukleoproteiner E1-E2 envelope) og 5 strukturelle (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteiner. Til hvert af disse proteiner syntetiseres AT, fundet i blodet af patienter med viral hepatitis C.