Bestemmelse af X- og Y-kromatin kaldes ofte en metode til eksplicit kønsdiagnostik. Cellerne i mundslimhinden, vaginalepitel eller hårsækken undersøges. I cellekernen i kvindelige celler er der to X-kromosomer til stede i det diploide sæt, hvoraf det ene er fuldstændig inaktiveret (spiraliseret, tæt pakket) allerede i de tidlige stadier af embryonal udvikling og er synlig som en klump heterokromatin bundet til cellekernens membran.