Mikrodeletioner af nærliggende gener på kromosomet forårsager et antal meget sjældne syndromer (Prader-Willi, Miller-Dicker, Di-Georgie osv.). Diagnose af disse syndromer blev mulig på grund af forbedringen af fremgangsmåden til fremstilling af kromosompræparater. I tilfælde af at mikrodeletionen ikke kan detekteres ved karyotyping, anvendes DNA-prober, der er specifikke for det område, der har undergået deletion.