Undersøgelse: gener påvirker frugters og fibres effekt mod kræft

Et nyligt studie offentliggjort i tidsskriftet eBioMedicine har identificeret genetiske variationer, der kan ændre sammenhængen mellem indtag af fibre, frugt og grøntsager og risikoen for kolorektal cancer (CRC). Forskerne identificerede med succes to signifikante loci, der ændrer sammenhængen mellem indtag af fibre og frugt og risikoen for CRC.

Kolonial kronologi (CRC) er en af de mest almindelige kræftformer i verden med næsten to millioner nye tilfælde og over 900.000 dødsfald i 2020. Et højt indtag af frugt, grøntsager, fuldkorn og kostfibre har vist sig at reducere risikoen for CRC. Selvom der er stærke beviser for en sammenhæng mellem CRC-risiko og indtag af fuldkorn og kostfibre, er beviserne for en sammenhæng mellem CRC-risiko og indtag af frugt og grønt fortsat begrænsede.

Tidligere genomomfattende associationsstudier (GWAS) har identificeret mindst 200 loci forbundet med CRC-risiko, hvilket forklarer op til 35 % af arveligheden. Selvom gen-miljø (G × E) interaktioner kan forklare yderligere arvelighed, har tidligere studier med små stikprøver og traditionelle metoder kun fundet et begrænset antal signifikante interaktioner. Nye statistiske tilgange, såsom conjoint tests og totrinsmetoder, der prioriterer enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er), har potentiale til at forbedre nøjagtigheden af disse analyser.

Op til 45 studier fra tre genetiske konsortier for CRC, herunder personer af europæisk afstamning, blev inkluderet i analysen. Studierne omfattede case-control-sæt til kohortestudier og kræftfri kontrolpersoner til case-control-studier. I alt 69.599, 69.734 og 44.890 deltagere blev analyseret for henholdsvis frugt-, grøntsags- og fiberindtag. Kostindtaget blev vurderet ved hjælp af spørgeskemaer om fødevarehyppighed og kosthistorik, typisk udtrykt som portioner pr. dag for frugt og grøntsager og gram pr. dag for total fiber.

Data blev harmoniseret og udtrykt som kvartilværdier efter køn og studie. Derudover omfattede genotypningskvalitetskontrol kontrol for manglende data, Hardy-Weinberg-ligevægt og kønsmismatch, efterfulgt af imputation og filtrering for mindre allelfrekvens og nøjagtighed, hvilket resulterede i en analyse af 7.250.911 SNP'er.

Sammenlignet med kontrolgruppen var deltagerne med CRC ældre, havde et højere kropsmasseindeks og energiindtag og en højere forekomst af risikofaktorer såsom familiehistorie med CRC og type 2-diabetes. De indtog også mindre fibre, frugt og grøntsager sammenlignet med kontrolgruppen. Metaanalyser fandt en omvendt sammenhæng mellem fiberindtag (relativ risiko pr. kvartilstigning (OR) = 0,79), frugtindtag (OR = 0,79) og grøntsagsindtag (OR = 0,82) og CRC-risiko.

3-DF-testen identificerede rs4730274-locuset opstrøms for SLC26A3-genet, hvilket viser en sammenhæng med fiberindtag og en interaktion med CRC-risiko. Stratificering efter genotype viste en stærkere invers sammenhæng mellem fiber og CRC for hver kopi af T-allelen. Funktionel annotation indikerede enhanceraktivitet i tyktarmsvæv med en eQTL for DLD-genet.

Rs1620977-locuset nær NEGR1-genet viste en signifikant association med frugtforbrug og en moderat interaktion med CRC-risiko. Stærke inverse associationer blev observeret med stigende frugtforbrug for hver kopi af G-allelen.

Undersøgelsen er den hidtil største G×E-undersøgelse, hvor forskerne identificerede to interaktioner mellem fiber, frugtindtag og risiko for CRC. Specifikt antyder rs4730274 nær SLC26A3-genet en signifikant sammenhæng mellem fiberindtag, tarmfunktion, inflammation og CRC. Resultaterne opfordrer til yderligere undersøgelser for at undersøge de kliniske implikationer og bekræfte disse fund i forskellige populationer.