Undersøgelse: Gener påvirker anti-kræft effektiviteten af frugter og fibre

En nylig undersøgelse offentliggjort i tidsskriftet eBioMedicine identificerede genetiske variationer, der kan ændre sammenhængen mellem fiber-, frugt- og grøntsagsindtag og risikoen for kolorektal cancer ( CRC). Forskere har med succes identificeret to væsentlige loci, der modererer sammenhængen mellem fiber- og frugtindtag og CRC-risiko.

CRC er en af de mest almindelige kræftformer i verden med næsten to millioner nye tilfælde og mere end 900.000 dødsfald i 2020. Højt indtag af frugt, grøntsager, fuldkorn og kostfibre er blevet rapporteret at reducere risikoen for CRC. Selvom der er stærke beviser for en sammenhæng mellem CRC-risiko og indtagelse af fuldkorn og kostfibre, er beviser på en sammenhæng mellem CRC-risiko og frugt- og grøntsagsindtag fortsat begrænset.

Tidligere genomomspændende associationsstudier (GWAS) har været i stand til at identificere mindst 200 loci forbundet med CRC-risiko, hvilket forklarer op til 35% af arvelighed. Selvom gen-miljø (G × E) interaktioner kan forklare yderligere arvelighed, har tidligere undersøgelser med små prøver og traditionelle metoder kun fundet et begrænset antal signifikante interaktioner. Nye statistiske tilgange, såsom conjoint tests og to-trins metoder, der prioriterer single nucleotide polymorphisms (SNP'er), kan potentielt forbedre nøjagtigheden af disse analyser.

Op til 45 undersøgelser fra tre genetiske CRC-konsortier inklusive individer af europæisk afstamning blev inkluderet i analysen. Undersøgelser omfattede case-kontroller til kohorteundersøgelser og kræftfri kontroller til case-kontrolstudier. I alt 69.599, 69.734 og 44.890 deltagere blev analyseret for henholdsvis frugt-, grønt- og fiberindtag. Diætindtaget blev vurderet ved hjælp af spørgeskemaer med madfrekvens og kosthistorier, normalt udtrykt som portioner om dagen for frugt og grøntsager og gram pr. Dag for total fiber.

Data blev harmoniseret og udtrykt som kvartiler efter køn og undersøgelse. Derudover omfattede genotypebestemmelseskvalitetskontrol kontrol for manglende data, Hardy-Weinberg-ligevægt og kønsinkonsistens, efterfulgt af imputation og filtrering for mindre allelfrekvens og præcision, hvilket resulterede i analysen af 7.250.911 SNP'er.

Sammenlignet med kontroller var deltagere med CRC ældre, havde et højere kropsmasseindeks og energiindtag og en højere forekomst af risikofaktorer såsom en familiehistorie med CRC og type 2-diabetes. De indtog også mindre fibre, frugt og grøntsager sammenlignet med kontrolgruppen. Meta-analyser fandt en omvendt sammenhæng mellem indtag af fiber (relativ risiko pr. Kvartil stigning (OR) = 0,79), frugt (OR = 0,79) og grøntsager (OR = 0,82) og risiko for CRC.

3-DF-testen identificerede rs4730274-locuset opstrøms for SLC26A3-genet, som viser en sammenhæng med fiberindtag og en interaktion med CRC-risiko. Stratificering efter genotype viste en stærkere omvendt sammenhæng mellem fiber og CRC for hver kopi af T-allelen. Funktionel annotation foreslog forstærkeraktivitet i tyktarmsvæv med en eQTL for DLD-genet.

Rs1620977-locuset nær NEGR1-genet viste en signifikant sammenhæng med frugtforbrug og en moderat interaktion med CRC-risiko. Stærke omvendte associationer blev observeret med stigende frugtforbrug for hver kopi af G-allelen.

Undersøgelsen er den største G × E-undersøgelse til dato, hvor forskere identificerede to interaktioner mellem fiber- og frugtindtag og CRC-risiko. Især rs4730274 nær SLC26A3-genet antyder en signifikant sammenhæng mellem fiberindtag, tarmfunktion, inflammation og CRC. Resultaterne kræver yderligere forskning for at undersøge de kliniske implikationer og bekræfte disse fund i forskellige populationer.